Las maestrías de la Universidad del Valle han sido organizadas en dos modalidades: de investigación y de profundización.
Puede ser reconocida como el primer tramo en la formación doctoral, implica una mayor dedicación en créditos a la investigación y plantea alcances superiores y con mas rigor en los trabajos investigativos, asociado con la definición de la AUIP tiene como meta la iniciación en la investigación.
Asociado con la definición de la AUIP, tinen como objetivo formar magisters con alta capacidad para la innovación del ejercicio profesional.
En el PPIEE, los programas de Maestría se ofrecen en un programa genérico y están organizados en énfasis de formación.